植物分子生物学研究组 |

Plant Molecular Biology

云南省自然科学奖一等奖

星期四 5月 11, 2017

2017年4月13日,云南省科技奖励大会在昆明海埂会堂举行,余迪求研究员在科技外事处陈吉岳处长的陪同下参加了此次奖励大会。其团队完成的“microRNA调控植物营养代谢和形态建成的分子机制”研究成果获得云南省自然科学奖一等奖。 

其研究成果“microRNA调控植物营养代谢和形态建成的分子机制”以植物遗传学、植物生理学和植物发育生物学为基础,通过分子生物学技术解析了4个miRNA的生物学功能。主要内容如下:(1)miR395通过控制APS和SULTR基因的表达从而精确调控硫酸根的转运和同化;(2)在低N情况下,植物可以上调miR826和miR5090的表达水平,从而抑制AOP2的表达;伴随着AOP2的下降,芥子油苷的合成受到抑制,从而减少对N的消费,最终使得植物表现出更强的低N适应性。(3)miR396通过调控GRF基因的表达,进而影响GRF-GIF复合物的形成,最终控制植物叶和花的发育。该研究成果丰富了植物miRNA的功能多样性,为深入研究miRNA的生物学功能奠定了基础。 


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拟南芥WRKY转录因子WRKY12/WRKY13调控植物开花诱导的分子机理

星期一 1月 23, 2017

WRKY转录因子是植物特有的一类蛋白质,在模式植物拟南芥中一共有74个成员,其主要功能是参与调控植物逆境胁迫反应。目前的研究表明,除了调控植物逆境胁迫外,WRKY转录因子还参与调控植物发育过程;然而,WRKY转录因子是否参与调控植物开花诱导及其信号网络和分子机理?目前还没有相关报道。 

  版纳植物园植物分子生物学研究组的余迪求研究员领导的团队研究发现,拟南芥WRKY12和WRKY13分别正调控和负调控植物在短日照条件下的开花, WRKY12基因突变导致植物开花延迟,而WRKY13基因突变使得植物开花提前。分子生物学及生物化学证据表明,WRKY12及WRKY13能够结合到花诱导信号基因FUL基因的启动子区域,进而直接调控FUL基因的表达。进一步研究表明,植物激素赤霉素(GA)信号途径的关键抑制子DELLA蛋白能有效地与WRKY12和WRKY13相互作用形成蛋白复合物,并影响它们的转录激活功能。该研究证实WRKY12和WRKY13功能通过相互拮抗的方式参与调控赤霉素介导的植物开花诱导。

  相关研究以The Arabidopsis WRKY transcription factors WRKY12 and WRKY13 oppositely regulate flowering under short-day conditions为题在Molecular Plant上发表 。博士研究生李委、王后平为该论文的共同第一作者,余迪求研究员为该论文的通讯作者。该研究得到国家自然科学基金(U1202264; 31171183)、中国科学院科学基金(KSCX3-EW-N-07) 、中国科学院135工程项目(XTBG-F04)及云南省“创新研究团队”项目(2014HC017)的资助。


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WRKY57参与调控植物激素茉莉酸信号转导及抗病性的分子机理

星期五 7月 22, 2016

 

 植物激素茉莉酸(Jasmonate)是一类重要的脂类生长调节物质,它们在植物适应环境的过程中发挥着极其重要的调控功能,但茉莉酸调控植物各种生理过程的信号转导机理仍有待深入研究。 

  版纳植物园植物环境适应性研究组与植物分子生物学研究组联合研究发现,WRKY57转录因子负调控拟南芥对真菌型病原菌灰霉菌(Botrytis cinerea)的抵抗。WRKY57基因受B. cinerea的诱导表达,wrky57突变体对该病原菌的抗性明显增强,而WRKY57高表达导致转基因植物对该病原菌非常敏感(图一)。机制研究表明,WRKY57与WRKY33竞争性地和VQ蛋白SIB1和SIB2相互作用,并竞争性地调控茉莉酸激素信号途径关键抑制子JAZ1JAZ5的表达,从而在一定程度上阻断了茉莉酸信号并削弱了WRKY33对B. cinerea的抵抗能力。 

      相关研究结果近期以WRKY57 Regulates JAZ Genes Transcriptionally to Compromise Botrytis cinerea Resistance in Arabidopsis为题在线发表在植物学主流学术期刊Plant Physiology上.


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植物激素赤霉素与光周期途径协同调控开花诱导的信号转导机理

星期五 7月 22, 2016

 

植物激素是植物体内重要的生长调节物质,广泛参与调控植物的生长发育和抗逆境反应。在模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)中,赤霉素激素(Gibberellin,GA)促进植物的开花诱导过程。目前研究表明,GA可与光周期(Photoperiod)信号协同调控植物在长日照条件下的开花诱导;然而,GA和光周期信号在植物开花诱导过程中的相互作用机理仍不清楚。 

  版纳植物园植物分子生物学研究组和植物环境适应性研究组联合研究发现,GA诱导成花素基因FT的表达依赖于光周期信号途径中的关键转录因子CO蛋白。分子生物学及生物化学实验表明,GA途径的抑制子DELLA蛋白能与CO相互作用形成蛋白复合物,并抑制其转录激活功能。进一步遗传学研究表明,DELLA蛋白抑制植物开花诱导部分依赖于CO/FT介导的光周期信号途径。该研究证实GA途径的抑制子DELLA蛋白能直接抑制光周期途径中的关键转录因子CO,从而协同调控植物在长日照条件下的开花诱导过程。 

      相关研究结果近期以The DELLA-CONSTANS transcription factor cascade integrates gibberelic acid and photoperiod signaling to regulate flowering为题在植物学主流期刊Plant Physiology上在线发表.


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拟南芥转录因子bHLH34和bHLH104调控铁平衡

星期四 4月 7, 2016

铁作为许多功能蛋白的重要辅助因子,对于植物的生长发育起着极其重要的作用。在人类中,缺铁是引起贫血症的主要原因之一,而植物性食物是人类获得铁的主要来源,因此研究植物体内铁的吸收,转运以及调控的机制是非常重要的。

版纳植物园植物分子生物学研究组的博士研究生李晓丽等在余迪求研究员和梁岗副研究员的指导下发现拟南芥转录因子bHLH34和bHLH104通过介导bHLH38/39/100/101基因的转录从而正调控缺铁响应过程。bhlh34bhlh104bhlh34bhlh104突变体都表现出了典型的缺铁症状,突变体中的缺铁响应过程被破坏,缺铁响应相关基因的表达显著下调。而bHLH34和bHLH104的高表达则激活了植物的缺铁响应并上调了缺铁响应相关基因的表达。瞬时表达实验表明bHLH34和bHLH104可以直接调控bHLH38/39/100/101的表达。bHLH101的高表达可以部分互补bhlh34bhlh104双突变体的表型。进一步分析发现bHLH34,bHLH104和bHLH105任意两者之间都可以形成同源或异源二聚体,而且bhlh34bhlh104bhlh34bhlh105bhlh104bhlh105双突变体的表型比三种单突变体的表型更加严重,说明bHLH34bHLH104bHLH105这三个基因的功能是相互叠加的,而不是冗余的。

该研究结果以Two bHLH Transcription Factors, bHLH34 and bHLH104, Regulate Iron Homeostasis inArabidopsis thaliana为题发表在Plant Physiology上。


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如何设计高效的植物sgRNA进行基因编辑

星期三 4月 6, 2016

  基于CRISPR/Cas9-sgRNA的DNA编辑系统已经发展成基因编辑的一个有效工具。CRISPR/Cas9-sgRNA系统包含两个主要组分—Cas9蛋白和sgRNA。sgRNA决定了基因编辑的位点和基因编辑的效率。研究已经表明,不同的sgRNA有不同的编辑效率。在动物和人类中通过高通量比较分析sgRNA的效率,研究人员已经获得了高效sgRNA的参数。与动物的细胞系转染不同,植物sgRNA介导的编辑效率需要在转基因后代中验证,因此,目前已报道的有效编辑的植物sgRNA仅有几百个。由于无效的植物sgRNA直接浪费科研人员的时间和金钱,因此选择高效率的sgRNA是避免该结果发生的一个有效途径。 

版纳植物园植物分子生物学研究组的梁岗博士等通过分析已有的有效和无效的sgRNA的二级结构,获得了直接控制sgRNA效率的关键参数。同时,针对目前构建多靶点CRISPR/Cas9-sgRNA载体的成功率较低的现状,开发了一个高效的构建多靶点CRISPR/Cas9-sgRNA载体的策略。通过该策略,将符合高效sgRNA参数的20多个sgRNA组装进不同的CRISPR/Cas9-sgRNA载体。在水稻中,对这些sgRNA的编辑效率进行了验证。结果表明,符合规定参数的sgRNA可以有效地对靶基因进行编辑。该研究成果为科研人员选择高效的植物sgRNA提供了参考。相关研究结果,以Selection of highly efficient sgRNAs for CRISPR/Cas9-based plant genome editing为题,发表在Scientific Reports上。


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VQ蛋白家族成员VQ12及VQ29协同调控植物的抗病性

星期五 10月 16, 2015

VQ蛋白家族是一类植物特有的蛋白,其名称源于它们都含有一段保守的VQ-motif。最近研究表明,某些VQ蛋白能跟WRKY转录因子相互作用,暗示它们可能参与调控植物的抗逆反应;然而,VQ蛋白家族成员参与调控植物抗逆反应的具体生物学功能及分子机理仍有待深入研究。

版纳植物园植物分子生物学研究组王后平博士和胡彦如博士在余迪求研究员指导下,系统开展了拟南芥VQ蛋白家族基因功能研究。研究工作发现,拟南芥VQ12及VQ29基因受植物抗病相关激素茉莉酸(JA)及真菌型病原菌灰霉菌(Botrytis cinerea)的强烈诱导表达。VQ29单突变体及VQ12VQ29双突变体对该病原菌的抗性明显增强,而VQ12及VQ29的高表达导致转基因植物对该病原菌非常敏感,表明VQ12及VQ29负调控植物对该病原菌的抗性(图一)。进一步研究表明,VQ12和VQ29蛋白不仅能自身相互作用形成同源二聚体,同时还能与其它VQ蛋白家族成员相互作用形成异源蛋白复合物。综上所述,VQ12和VQ29蛋白协同负调控植物对B.cinerea的抗性。

相关研究以Arabidopsis VQ motif-containing proteins VQ12 and VQ29 negatively modulate basal defense against Botrytis cinerea为题在Scientific Reports上发表。该研究得到国家自然科学基金-青年科学基金(31401040)、中国科学院青年创新促进会、中国科学院“西部之光”项目及云南省“创新研究团队”项目(2014HC017)的资助。


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植物miRNA介导了不同营养元素代谢信号之间的交叉调控

星期五 10月 16, 2015

 

为了维持正常的生长发育,植物需要整合碳,氮,硫等营养代谢途径。近来的研究表明植物miRNA在调控植物营养代谢方面起着关键的作用。

版纳植物园余迪求研究员团队梁岗副研究员等系统分析了植物miRNA响应C,N,和S代谢的表达变化,阐述了植物miRNA参与调控植物C,N,和S代谢信号交叉的可能的分子机制。通过分别对拟南芥进行缺N,缺C或缺S处理,利用高通量深度测序技术鉴定了大量特异响应和普遍响应元素缺乏情况的植物miRNA。这些差异表达miRNA的靶基因主要参与转录调控,生长素信号转导,营养稳态和发育调控等。C,N和S缺乏分别特异性地诱导了miR169,miR826和miR395的表达,而这些营养缺乏共同抑制了miR167,miR172,miR397,miR398,miR399,miR408,miR775,miR827,miR841,miR857和miR2111的表达。进一步研究发现,受某一特定元素缺乏诱导的miRNA常常受到其他多种元素缺乏的抑制。转基因植物分析发现,改变元素缺乏诱导的miRNA的表达可以改变植物对多种因素缺乏环境的适应性。该研究表明miRNA在植物调控不同营养代谢之间的信号传导方面起着重要的作用。

该研究成果以Uncovering miRNAs involved in crosstalk between nutrient deficiencies in Arabidopsis为题发表在Scientific Reports杂志上。


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拟南芥BIN2激酶与ABI5转录因子相互作用调控BRs与ABA平衡介导种子萌发

星期五 10月 16, 2015

植物种子萌发和萌发后发育(Seed germination and postgerminative growth)受到植物体内多种信号分子和外界环境因子所调控。例如,植物激素脱落酸(Abscisic acid,ABA)抑制植物种子萌发和萌发后发育,而油菜素内酯(Brassinosteroids,BRs)拮抗ABA的抑制效果,从而促进种子萌发和萌发后发育。但是BRs和ABA在植物种子萌发和萌发后发育过程中的交叉调控信号通路及分子机理仍有待进一步揭示。

最近,版纳植物园余迪求研究员所领导的植物分子生物学组胡彦如副研究员研究发现,植物激素BRs信号转导途径中的关键激酶BIN2正调控ABA信号通路,从而抑制种子萌发和萌发后发育。一系列遗传学和分子生物学分析表明,BIN2正调控ABA信号通路依赖于ABA信号途径中的关键转录因子ABI5蛋白,且通过相互作用方式与之形成蛋白复合体。进一步研究表明,BIN2激酶能磷酸化ABI5转录因子,从而稳定ABI5蛋白水平及其生物学功能。相一致的是,ABI5蛋白磷酸化位点的突变不仅导致其不能被BIN2磷酸化,而且导致其不能发挥正常的生物学功能。此外,BRs和BIN2参与调控内源ABI5蛋白的积累,同时影响ABI5下游基因的表达水平。该研究证实BRs信号转导途径中的关键激酶BIN2能直接激活ABA信号途径中的关键转录因子ABI5,从而介导BRs和ABA激素之间的平衡,进而控制植物种子萌发和萌发后发育。

相关研究以BRASSINOSTEROID INSENSITIVE2 Interacts with ABSCISIC ACID INSENSITIVE5 to Mediate the Antagonism of Brassinosteroids to Abscisic Acid during Seed Germination in Arabidopsis为题在植物学刊物Plant Cell上在线发表。

该研究得到国家自然科学基金-云南省联合基金(U1202264)、国家自然科学基金-青年科学基金(31401040)及中国科学院“西部之光”项目的资助。


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AtWRKY53通过介导气孔运动负调控植株抗旱性

星期五 10月 16, 2015

WRKY家族是一个转录调控因子大家族,在拟南芥中拥有74个成员。WRKY家族各成员参与多种生命活动,在植物的生长发育和耐逆抗病过程中都发挥着极其重要的调控作用。AtWRKY53是拟南芥WRKY基因家族第III组成员。目前已有报道指出AtWRKY53在调控植物衰老和生物胁迫方面起着重要作用。干旱是限制农作物增产的一个重要环境因子之一。尽管如此,植物对干旱耐受性的潜在分子机制却仍不清楚。

版纳植物园余迪求研究员指导的博士研究生孙一丁通过研究发现干旱胁迫能诱导提高拟南芥WRKY53的mRNA水平和蛋白水平。进一步的表型分析发现,与野生型植株相比,高表达植株对干旱胁迫更为敏感,气孔运动测试及ABA含量测定结果表明高表达植株气孔关闭受限与ABA信号无关。进一步分析发现高表达植株气孔保卫细胞中过氧化氢含量减少而苹果酸含量增加,定量PCR结果显示过氧化氢酶CAT2CAT3以及淀粉降解酶QQS基因的表达明显高于野生型植株,染色体免疫共杂交实验结果表明AtWRKY53转录因子可以结合到QQS基因的启动子区域。以上结果表明高表达AtWRKY53通过降低保卫细胞中过氧化氢含量以及提高苹果酸含量来促进气孔开放,从而导致AtWRKY53植株对干旱敏感。

该成果以为Activated expression of AtWRKY53 negatively regulates drought tolerance by mediating stomatal movement题发表在Plant Cell Reports上。


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